Программа для объединения и выравнивания нуклеотидных последовательностей NucleoCom
Открыть
Дата: 2022-12-26
Автор
Кротова, Ольга Сергеевна
Давыдов, Евгений Александрович
Стрельцова, Юлия Сергеевна
Выходные сведения
Свидетельство о регистрации программы для ЭВМ № 2023610882 Российская Федерация. Программа для объединения и выравнивания нуклеотидных последовательностей NucleoCom : № 2022686384 : заявл. 26.12.2022 : опубл. 13.01.2023 / Кротова О. С., Давыдов Е. А., Стрельцова Ю. С. ; правообладатель: Алтайский государственный университет. – 1 с.
Аннотация
Программа предназначена для объединения различных фрагментов нуклеотидных последовательностей (молекулярных маркеров) для операционных таксономических единиц (OTU) из пересекающихся списков в единый файл с последующим выравниванием по алгоритму MAFFT. С помощью программы решается проблема автоматизации рутинных операций
объединения последовательностей с различными наименованиями одних и тех же OTU для разных молекулярных маркеров, а также оперативное изменение состава OTU и молекулярных маркеров в результирующем файле. Входные файлы: файл csv-формата с названиями последовательностей, fasta-файлы, содержащие последовательности. Выходной файл содержит объединенные последовательности (могут быть выравнены по запросу пользователя). Тип ЭВМ:
IBM PC - совмест. ПК; ОС: Windows 8-11.